上海晶抗生物多重PCR試劑盒簡(jiǎn)介:
多重PCR試劑盒是一種在普通PCR基礎(chǔ)上建立的一種可以同時(shí)擴(kuò)增多個(gè)目的片段的檢測(cè)多種細(xì)菌分子生物學(xué)的技術(shù),其利用多對(duì)特異性引物同時(shí)擴(kuò)增,提高了擴(kuò)增效率,節(jié)省了成本。優(yōu)點(diǎn)在于檢測(cè)的速度快、準(zhǔn)確性高和操作簡(jiǎn)單,特別適用于臨床、環(huán)境和食品檢測(cè)等領(lǐng)域。
原理:
多重PCR試劑盒快速檢測(cè)通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則從而完成單鏈DNA的延伸工作,最終完成DNA雙鏈的配對(duì)合成。
多重PCR與常規(guī)PCR的區(qū)別在于同一個(gè)反應(yīng)體系中所加入的引物對(duì)數(shù)不同。多重PCR可以特異性擴(kuò)增出多條目的DNA片段。反應(yīng)體系的組成和PCR循環(huán)的條件需要經(jīng)過(guò)優(yōu)化以確保同時(shí)擴(kuò)增多個(gè)DNA片段。理論上只要PCR擴(kuò)增的條件合適,引物對(duì)的數(shù)量可以不限,但由于各種條件的限制,實(shí)際能夠擴(kuò)增的引物對(duì)數(shù)量是有限的(~1000對(duì))。
材料與儀器:
目的菌株,胰蛋白胨,細(xì)菌DNA提取試劑盒,LB液體培養(yǎng)基,LB固體培養(yǎng)基;PCR熱循環(huán)儀,PCR擴(kuò)增儀等。
步驟:
1. 引物設(shè)計(jì):選擇序列長(zhǎng)度在500bp以上的基因設(shè)計(jì)引物。先用Primer軟件,之后通過(guò)Oligo軟件和BLASTN算法進(jìn)行分析,選擇二聚體少,自身不會(huì)形成發(fā)卡結(jié)構(gòu),Tm值在60℃左右且與非DNA同源性較低的引物作為該基因的特異性引物,并送公司進(jìn)行合成。最好進(jìn)行引物評(píng)價(jià)實(shí)驗(yàn)。
2. 提取目的菌株DNA:吸取樣品勻液,5000r/min離心后棄去上清,參照細(xì)菌DNA提取試劑盒進(jìn)行操作,提取樣品的基因組DNA。
3. 測(cè)定DNA濃度及純度:當(dāng)260nm/280nm的比值在1.8-2.0之間表明提取的基因組DNA質(zhì)量較好。
4. 多重PCR檢測(cè):將所提取的基因組DNA作為模板,以設(shè)計(jì)的引物(SU4,smal,clfA)進(jìn)行多重PCR反應(yīng),25μL多重PCR反應(yīng)體系為:2.5Μl10XPCRBuffer,1.0μLMgCl2(4mM),2.5μLdNTPMixture(各2.5mM),0.5μLTaq酶(5.0U),2.0μLDNA模板,引物(10umol),添加SU4,smal,clfA分別為2.6μL、0.5μL、1μL,ddH2O補(bǔ)足至25μL。
5. PCR反應(yīng)程序?yàn)椋孩?4℃5min;②94℃30s;③58℃30s;④72℃45s;⑤72℃10min。②-④步重復(fù)30次。
6. 配置1.5%瓊脂糖凝膠,使用電泳檢測(cè)多重PCR反應(yīng)產(chǎn)物。
7. 在EB液中染色10~15分鐘后置于凝膠成像儀下查看電泳條帶結(jié)果。
注意事項(xiàng):
1. 當(dāng)比值大于2.0表明提取的基因組DNA中RNA含量較高,應(yīng)加入一定量的RNase酶去除溶液中的RNA。
2. 目的片段長(zhǎng)度不盡相同,而較小片段總是優(yōu)先擴(kuò)增;
3. 各對(duì)引物最佳PCR條件不相同,較長(zhǎng)的片段需要較長(zhǎng)的延伸時(shí)間。為了保證最終擴(kuò)增產(chǎn)量的一致性,在優(yōu)化反應(yīng)條件的時(shí)候,盡可能選擇有利于較大片段的擴(kuò)增條件。
4. 多重PCR體系中,引物用量與擴(kuò)增的目的片段長(zhǎng)度有著正比內(nèi)在關(guān)系,即擴(kuò)增片段越長(zhǎng),所需引物相對(duì)越多,另外引物間的相互影響會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增效果不佳。
5. DNA聚合酶的最適濃度為每25uL反應(yīng)體積中添加2U,實(shí)際根據(jù)擴(kuò)增效果進(jìn)行輕微調(diào)整。
6. 高鹽濃度會(huì)使長(zhǎng)片段的擴(kuò)增產(chǎn)物難于變性解鏈。因而長(zhǎng)片段產(chǎn)物在低鹽濃度下擴(kuò)增效果較好,而短片段產(chǎn)物在高鹽濃度下擴(kuò)增效果較好??梢赃m當(dāng)提高PCR緩沖液濃度,或者提高K+濃度至70~100mM。
7. 不同的細(xì)菌類(lèi)型和樣品類(lèi)型可能需要不同的提取和擴(kuò)增方法,需要根據(jù)具體情況選擇合適的方法。同時(shí)在進(jìn)行PCR試劑盒擴(kuò)增反應(yīng)時(shí),需注意控制反應(yīng)條件和減少污染,以確保準(zhǔn)確性和可靠性。
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